本实用新型涉及水体灭菌领域，具体涉及一种水体灭菌消毒机，包括基座、储水箱、搅拌箱组件、灭菌盖和过滤组件，基座上设有储水箱和搅拌箱组件，储水箱底部与搅拌箱组件底部相连通，搅拌箱组件上设有灭菌盖，搅拌箱组件与过滤组件相连，搅拌箱与过滤组件相连接；所述灭菌盖包括灭菌盖本体、灭菌盖腔、伸缩套筒一、伸缩套筒二和紫外线灯一，灭菌盖本体内设置有灭菌盖腔，灭菌盖腔内固定有伸缩套筒一，伸缩套筒二套装与伸缩套筒一内，伸缩套筒二底部固定有紫外线灯一；所述过滤箱上部设有过滤箱检查口，过滤箱内从上往下依次设有细砂过滤层、粗砂过滤层和砂砾层，过滤箱上部一侧与搅拌箱出水管一端相连通，本实用新型结构简单，灭菌效果好。