本实用新型提供一种温室大棚生物反应堆系统，属于作物种植技术领域。该温室大棚生物反应堆系统包括棚体、生物反应堆及空气调节系统，棚体包括前墙体、后墙体及棚顶，前墙体与后墙体具有空腔，前墙体的内壁上开设有气体排放口，且外壁上开设有排气总口。后墙体的内壁上开设有气体收集口，且外壁上开设有集气总口。空气调节系统包括动力风机、集气总管及排气总管，集气总管一端连接集气总口，排气总管一端连接排气总口。在动力风机的作用下，集聚在地面附近的高二氧化碳浓度气体进入集气总管，并经排气总管循环返回棚体内，使得二氧化碳在棚体内分布均匀，提高生物反应堆的使用效率，也防止二氧化碳在局部聚集，导致安全事故。