本实用新型公开了一种海上岛礁用的可漂浮建筑结构，包括底座和漂浮建筑本体，所述底座上固定安装有建筑运输防护装置，所述漂浮建筑本体通过建筑运输防护装置与底座活动连接，所述建筑运输防护装置包括固定座和四个第一密封防护板，所述固定座固定安装在底座的上表面，所述固定座的上表面固定连接有锚链的一端，所述锚链的另一端固定连接在漂浮建筑本体的下表面，四个所述第一密封防护板均固定连接在底座的上表面，四个所述第一密封防护板的上表面开设有第一滑槽。本实用新型通过上述等结构的配合，实现了方便漂浮建筑本体的运输，并根据水位自动调节防护高度，阻挡海浪对其的影响，使其漂浮的更加稳定的效果。