本实用新型涉及一种泳池水质生态物理除菌净化装置，包括过滤缸和除菌缸，过滤缸内从下到上依次铺设有第一玻璃滤料层、第二玻璃滤料层、第三玻璃滤料层和第四玻璃滤料层，过滤缸的缸口上安装有多路控制阀，多路控制阀的中心管伸入第一玻璃滤料层底部，多路控制阀的入水口上连接有进水管，多路控制阀的出水口上连接有出水管，除菌缸内填充有μNM自净化粒子，除菌缸的缸口上安装有黑二通水阀，多路控制阀上的出水管与黑二通水阀的入水口连接，黑二通水阀的出水口上连接有与泳池顶部连通的回水管。本实用新型的整个净化过程没有添加任何化学物质，不会给人带来安全隐患，节能环保，并且可对过滤缸进行反清洗，过滤缸可重复多次使用，节省成本。