本实用新型公开了一种发酵除菌式饲料加工装置，包括支撑架，所述支撑架的上端面固定安装有多层除菌发酵仓，所述多层除菌发酵仓包括外仓壳、加湿管、发酵室、饲料发酵盒、转动底座、灭菌装置和无菌盖，所述外仓壳设在多层除菌发酵仓的外部，所述灭菌装置固定安装在外仓壳的侧端面，共设三组，且呈均匀等距分布，所述转动底座固定安装在外仓壳内部底端，所述发酵室固定设置在转动底座的上端面，所述无菌盖固定连接在发酵室的上端面，所述发酵室的内部通过分料管连接多组饲料发酵盒。该种实用新型设计合理，使用方便，能够便于发酵家禽食用饲料，同时增添加工流程，提高其实用性，适合广泛推广。