本实用新型涉及蚯蚓养殖设备技术领域，且公开了一种蚯蚓与蚯蚓粪的分离机械系统，包括分离箱，所述分离箱的顶部铰接有箱盖，所述箱盖底部的两侧均设有第一照明灯，所述分离箱侧面的顶部固定安装有第一电加热装置，且分离箱正面中部的两侧设有热释电红外传感器，所述分离箱的正面设有等距排列的三个土壤温度变送器，所述土壤温度变送器上设有位于分离箱内部的金属探针。该蚯蚓与蚯蚓粪的分离机械系统，通过连接箱连接的三组分离室和连接箱与三组分离室连接口的三组滤孔大小不同的滤网，并配合连接箱上的第二电加热装置和第二照明灯，对蚯蚓进行多级分离，便于在蚯蚓和蚯蚓粪的分离过程中，同时将不同大小的蚯蚓分离开。