本实用新型公开了一种便携式水质微型生物监测装置，包括蓄电池、半导体制冷片、微生物检测仪和提取滴管，所述蓄电池安装于箱体底部的内侧，且箱体的中部设置有培养腔，所述半导体制冷片铺设于培养腔的内壁上，且培养腔内滑动连接有安装板，所述安装板边侧的内部设置有主动齿辊，所述主动齿辊通过皮带传动连接有从动齿辊，所述安装板的边侧开设有活动槽，所述活动板一端位于对接槽内，且对接槽开设于培养腔的内壁上，所述微生物检测仪和提取滴管安装于箱体顶部的内侧，所述箱体的顶部设置有导轴。该便携式水质微型生物监测装置，实现水质的采集、储存、培养和监测工作，同时方便携带，提高水质监测效率。