本实用新型提供一种蓄水屋面等高变形缝防水结构，相邻屋面板之间设有变形缝，该变形缝两侧的屋面板端部砌筑有挡墙，屋面板上方由下而上依次设有防水结构层、钢筋混凝土水池，钢筋混凝土水池包括底板与侧墙，该底板与侧墙的转角处设有倒角，侧墙与挡墙之间设有第一挤塑板，且第一挤塑板的上端部与下端部均设有密封胶层密封，钢筋混凝土水池内表面涂抹有防水砂浆层，该防水砂浆层延伸至侧墙顶面且覆盖密封胶层，挡墙顶面铺设有附加防水结构层，该附加防水结构层两端均铺设至侧墙顶面上方的防水砂浆层表面，本实用新型蓄水屋面等高变形缝防水结构提高了蓄水屋面变形缝处防水性能，降低了蓄水屋面发生渗漏的概率。