本实用新型公开了一种用于农产品冷链物流运输中自动调温的控制系统，包括第一处理器，所述第一处理器的输出端分别单向电连接有警示模块和数据传输模块，所述第一处理器的输入端分别单向电连接有数据接收模块、温度传感器和湿度传感器。本实用新型通过设置第一处理器、警示模块、数据传输模块、数据接收模块、温度传感器、湿度传感器、第一存储模块、GPRS定位模块、温湿度对比模块、温湿度调节器、远程终端、第二处理器、第二存储模块、显示器和控制按键的配合使用，解决了目前不可同时对多个运输车内部进行监控的问题，该用于农产品冷链物流运输中自动调温的控制系统，具备可同时对多个运输车内部进行监控的优点，值得推广。