一种固态发酵高活性饲用复合酶发酵系统，包括发酵房、空气加热箱、空气制冷箱、空气混合装置、通风补氧装置、供水装置、废水回收槽，空气加热箱的出口端与空气混合装置通过热空气输送管道连通，空气制冷箱的出口端与空气混合装置通过冷空气输送管道连通，空气混合装置的出口端通过管道与发酵房的内部连通，发酵房的顶部通过空气循环管道与空气加热箱连通，通风补氧装置设置在发酵房顶部，供水装置通过输水管道与发酵房内部连通，废水回收槽的入口端通过废水管道与发酵房的内部连通。本实用新型可根据复合酶发酵的不同阶段所需的发酵条件的不同，调整发酵房的温度、湿度、氧气量，使复合酶发酵处于最优状态，从而提高复合酶的发酵质量。