本实用新型公开了一种制药行业双风机空调系统，包括空调机箱、回风管与出风管，空调机箱内依次装设有回风机段、排风段、新风段、过滤段、表冷段、加热段、加湿段、送风机段、高中效过滤送风段，其中回风机段靠近回风管设置，高中效过滤送风段靠近出风管设置，排风段上连接有排风管，在该排风管上依次设置有第一手动调节阀与第一电动调节阀，在排风管的远端形成有排风口，在排风段与新风段之间设置有零压阀，新风段上连接有新风管，在该新风管上依次设置有第二手动调节阀与第二电动调节阀，在新风管的远端形成有新风口。其显著效果是：充分利用了冬季室外的冷空气，实现了冬季变新风比，使得空调系统可以全年变新风比运行。