本实用新型公开了一种特种树脂色谱分离装置，涉及色谱分离技术领域，包括主体和清理装置，所述主体的上侧设置有盖体，且主体的内部中间设置有过滤网，所述主体的下侧设置有斜板，所述盖体的中间贯穿有旋转轴，且盖体的中间设置有第一储液槽，所述过滤网的下方设置有第二储液槽，所述第二储液槽的下侧连通有色谱柱。本实用新型设计新颖，驱动电机通过旋转轴带动搅拌叶转动，使得特种树脂处于流动状态，增加了过滤效果，通过六个喷头使特种树脂均匀的分散在过滤网上侧，以便对特种树脂更好的进行分离，通过清理杆、门体、连接杆、连接槽、弹簧和清理箱之间的配合，将主体内部表面残留的特种树脂进行清理收集。