本实用新型揭示一种灭活疫苗封闭式全自动灌装机，包括第一传输带和第二传输带，第一传输带和第二传输带的左、右两侧均固定连接有传输带支架，第一传输带的底部通过传输带支架固定连接有储水箱，储水箱内腔的底部固定安装有水泵，储水箱的左侧设置有接水箱，接水箱与储水箱的连通处固定安装有过滤器，第一传输带的顶部固定连接有冲洗箱，冲洗箱的顶部贯穿连接有连接固定杆；本实用新型灭活疫苗封闭式全自动灌装机，通过冲洗箱、喷水头、连接固定杆和滑动杆等结构，可以使装载瓶的清洗更加方便快捷，同时利用擦洗滚筒对传输带进行全面的擦洗，起到了防止药液或化工液体污染传输带的作用，解决了装载瓶表面残留药液和传输带清洁的问题。