本实用新型公开了一种移液管清洗装置，包括外侧壁设置综合注水口和超纯水注水口的外箱体，其内侧壁上安装注入蠕动泵，外箱体内设置内清洗箱，内清洗箱内部设置移液管固定架，移液管固定架上形成多个移液管固定孔，内清洗箱箱体外侧分别设置相互连通的废液排出口和排出蠕动泵，废液排出口一端与内清洗箱连通，另一端伸出外箱体；注入蠕动泵进口端与综合注水口和超纯水注水口连通，出口端与注入管连通；注入管水平设置于内清洗箱上方，其另一端管头封闭，且通过固定钩与内清洗箱侧壁固定；注入管的管壁连通多个清洗针。本实用新型实现各体积规格移液管的自动清洗，且在清洗后，采用风干的方式对移液管进行快速干燥，有效提高工作效率。