本实用新型公开了一种小型实验室用橡胶打孔器，包括固定外壳，所述固定外壳的内壁上从下到上依次固定连接有放置底座和夹具，所述夹具的中间活动连接有橡胶塞，所述固定外壳的上端活动连接有限位件，所述限位件的内部活动连接有电钻主体。该小型实验室用橡胶打孔器，采用螺纹连接的固定外壳和限位件，使得二者便于拆装；采用和工作台面留有一定距离的放置底座，并在放置底座的中间开设圆孔，使得打孔之后钻头不会立刻碰到工作台面，可以保护工作台面不受损；采用带限位凹槽的限位件和带限位凸起的电钻，使得电钻可以顺着限位件上下移动，保证打孔时钻头的垂直性，防止打孔打歪；该装置体积小、使用方便，且成本较低，适用于实验室的橡胶塞打孔。