本实用新型提出了一种河道水体清理装置，包括底座，所述底座上设有环形的隔离网，所述隔离网内设有旋转过滤装置，所述旋转过滤装置包括位于所述底座内的电机，所述电机输出端连接有转轴，所述转轴竖直设置于所述底座上，所述转轴上设有若干菌群填料盘，所述菌群填料盘的圆周上粘合有若干尼龙丝；所述转轴顶部设有泵氧装置；所述隔离网上部的侧壁上设有刮泥装置，本装置使用时是多个排列在河道的排入口位置，对排入河道位置通过菌群进行净化，保证上游位置的纯净度，并且通过设置了隔离网，有效防止泥砂对菌群繁衍的影响，大大提高净化效率，同时，设置的菌群填料盘以及尼龙丝，能够增加菌群的附着量，增加净化能力。