本实用新型涉及生物制造技术领域，且公开了一种从植物种中提取细菌的装置，包括工作台，所述工作台顶部的一侧固定安装有灭菌皿，所述工作台的顶部固定安装有位于灭菌皿一侧的中和皿，所述工作台的顶部规定安装有位于中和皿一侧的分离装置，所述工作台的顶部固定安装有位于分离装置一侧的培养基。该从植物种中提取细菌的装置，通过螺杆和活塞、分离皿的相互配合，当上清液生成之后，便通过转动螺纹套杆来带动活塞向上移动，使得上清液也随之向上移动，最终溶液表面的上清液最先溢出到环形槽中，并通过环形槽和排放槽流入培养基中，通过螺纹套杆能精确的调整液面的高度，使得上清液的提取更加方便。