本实用新型涉及沼气输送技术领域，尤其是一种带有过滤机构的沼气输送系统，包括沼气气柜，沼气气柜的一侧设有过滤筒，过滤筒包括下滤筒和上滤筒，下滤筒和上滤筒之间通过多个锁紧件固定连接，且下滤筒的底部竖直连通有进气管，进气管与沼气气柜之间通过第一输气管连通，下滤筒和上滤筒内部分别水平安装有二级过滤网和一级过滤网，二级过滤网和一级过滤网的底端共同设有清扫机构。本实用新型通过设置一级过滤网和二级过滤网，从而可以对沼气中的杂质进行净化过滤，有效提高沼气燃烧的纯度；设置清扫机构，可以对一级过滤网和二级过滤网进行清扫，避免杂质堆积在一级过滤网和二级过滤网表面，影响沼气的通气效率。