本实用新型公开了一种干旱地区水窖集流自动控制与水质净化系统，包括进水渠、截污池、沉淀池、过滤池和控制系统，进水渠水流方向的前端分为两个分支水渠分别连接截污池和沉淀池，沉淀池、过滤池、水窖依次连接；进水渠的进水端、截污池及沉淀池的进水处分别设置闸门，闸门上设有电机，电机与对应闸门上设置的转轴连接；控制系统包括MCU控制终端、单片机及与单片机信号传输的液体传感器、水位传感器和控制器，MCU控制终端与单片机电连接，进水渠的进水口处的闸门设置液体传感器和水位传感器，截污池和水窖中均设有水位传感器。本实用新型结构简单，操作方便，水窖集流自动化控制程度高，水质净化效果好，提高了雨水的利用率，具有很好的应用价值。