本实用新型公开了一种新旧建筑屋面的防水结构，包括第一建筑和第二建筑，所述第一建筑位于第二建筑的左侧，所述第一建筑与第二建筑之间存在伸缩缝，所述第二建筑的上方安装有防水机构，所述防水机构的左侧通过贴紧机构与第一建筑紧密贴合，所述伸缩缝的内部右侧设有排水机构，所述防水机构的中心内部安装有过滤机构。该新旧建筑屋面的防水结构，通过第一建筑、第二建筑、板材、弹簧和螺钉之间的配合，解决了无法在新旧建筑高度相差较高的情况下使用的问题，通过板材、排水口、竖管、防水层、滤网和去腥香皂之间的配合，使雨水通过滤网和去腥香皂两道工序再从竖管下端排出，解决了现有雨水直接落在伸缩缝的内部造成异味的长期残留的问题。