本实用新型公开了一种全自动控制的造纸工业废水深度处理系统，包括缓冲池、深度反应系统、沉淀系统、标准沟检测系统、DCS自动控制系统；所述缓冲池、深度反应系统、沉淀系统、标准沟检测系统顺次连接，并通过回路系统与DCS自动控制系统相连接；所述深度反应系统包括深度反应池、加药系统、检测装置；深度反应池与加药系统相连接，检测装置设置在深度反应池的进水口和出水口上；所述加药系统与检测装置通过回路与DCS自动控制系统相连接。本实用新型具有低能耗、高效率，低成本、出水水质稳定、自动化程度高的特点，能够及时根据检测到的数据反馈及时对整个系统的进水量、加药量、排污量等进行自动控制。