本实用新型公开了一种处理压舱水及底泥的装置，包括消毒罐和抽水管，所述的抽水管一端通过竹节头与消毒罐的一端连接，所述的消毒罐内自左而右依次设有过滤网、格栅板和紫外线灯管，所述的格栅板成对且交叉布置，在每个格栅板的两侧均设有过水孔，所述的消毒罐另一端设有排水管；所述的抽水管另一端设有与其相连的镂空支架，所述的镂空支架上设有旋转电机，所述的旋转电机外围设有防水罩，所述的旋转电机输出端连接有旋转轴，所述的旋转轴上设有搅拌叶，所述的搅拌叶外围设有与镂空支架连接的镂空防护罩。本实用新型的装置，在实现对压舱水消毒杀菌处理的目的的同时，还可以有效清除船舶蓄水舱底部的底泥，有效防止水生物滋生而损坏船舶的问题。