本实用新型公开了一种微生物实验培养箱，包括主箱体，所述主箱体为一侧开口的矩形箱状结构，主箱体的开口处通过铰链连接有箱门，主箱体的内部底端四角处设有四组呈矩形阵列分布的底孔，所述主箱体的内部固定焊接有竖直设置的两组箱内板，两组所述箱内板将主箱体的内部分隔成第一至第三方腔，所述第一至第三方腔的底端均设有方形底口，所述第一方腔和第三方腔的内部设有第一内箱，所述第二方腔的内部设有第二内箱，所述第一内箱和第二内箱的结构相同且第一内箱和第二内箱的尺寸不同，第一内箱和第二内箱的内部两组侧壁上均设有相对应的若干槽条。本实用新型可根据需求灵活调整各培养皿之间的间距和高度，适合普遍推广使用。