本实用新型公开了一种小型分离式细胞培养箱，包括盒体、连通管和箱体，所述盒体各个壁均由透明材质制成，可放置于显微镜载物台上，并且侧壁连有弹簧和挡板用于固定细胞培养皿、培养板或培养瓶；所述连通管由盒体侧壁连出，接合于箱体顶壁，并且始端和末端均接有密封圈和滤网，用于连通盒体和箱体内的气体环境；所述箱体外壳设有控制面板和警报器，并且内部设有温度、湿度和气体浓度感应器，此外内部还设有温度调节器、湿度调节器、换气机和二氧化碳气体瓶等设备，可维持细胞培养所需的特定外部环境。本实用新型合理利用了显微镜载物台上的有限空间，提供了一个既能保障细胞生长的适宜外部环境，又有利于研究人员实时动态观测细胞的新型优化平台。