本实用新型提供一种绿色生态污水净化系统，其包括隔栅池、调节池、沉砂池、配水池、生态净水单元池、输送管以及排放池；其中，调节池与隔栅池连通，沉砂池与调节池连通，配水池与沉砂池连通，生态净水单元池包括依次从上到下分布的土壤覆盖层、第一通风过水层、第一组合防堵层、生化反应层以及防渗层，输送管一端的输入口连接配水池，另一端的输出口连接生态净水单元池输送水，排放池与排水槽连通，用于储集生态净水单元池排出的净化水。本实用新型的绿色生态污水净化系统在土壤覆盖层上种植陆生植物，降低蚊虫滋生，依靠过滤层的过滤以及菌类对各种污染物的降解，从而获得稳定高效的生物反应系统，创造经济价值。