本实用新型公开了一种城市河道清洁系统，包括：截水坝，截水坝的底部位于河床的基槽内，基槽内设置有支撑截水坝的基座，截水坝坝前的基槽内设置有坝前夯实土层，截水坝坝后的基槽内设置有坝后夯实土层；地下鼓风机房，地下鼓风机房内设置有控制器、电源模块以及鼓风机；U型镂空管道，其包括设置在坝前夯实土层顶部的第一镂空管道、设置在坝后夯实土层顶部的第二镂空管道以及连接第一镂空管道、第二镂空管道的连接管；填充区。本城市河道清洁系统利用涌泉机理，将生物净化水质的方向有水平调整为垂直方向，利用U形连通器液位差产生水压力导致水流动原理，实现了上下游水力贯通，可对城市河道水质有较大提升。