本实用新型提供一种具有防护功能的水位自记井。所述具有防护功能的水位自记井包括：水位井、河道断面和固定锚，所述水位井设置于所述河道断面的内部，所述固定锚放置于所述河道断面的中的河中；水位自记台，所述水位自记台设置于所述水位井的顶部。本实用新型提供的具有防护功能的水位自记井，可以避免大杂物、泥浆等不会因为重力原因进入井内，而且通过过滤嘴过滤掉密度小的杂物，以及通过弹性伸缩绳的设计，保证进水口的稳定性及使得进水口处与河道上层，从而保证井内水为上层较干净的河水，以及通过第一进水管和第二进水管接头处在最低点，通过拧开螺纹接头可以轻易清理管内沉淀物，便于拆换、维护。