本实用新型公开了一种底栖生物样品分装设备，包括箱体和安装台，所述箱体内加工有支撑台，支撑台的上方设置安装板，所述安装台设置在安装板的上端面，安装台的上端面加工导向槽，本实用新型采用压板与瓶盖配合，对拦网进行夹持固定，并由拦网与气口配合，对样品瓶内的底栖生物进行防护，保证空气的流通，并且样品瓶与安装台成组对应，更加方便分类，避免样品混杂；采用盖板与安装台配合，对定位柱进行限位封装，并由导向槽进行导向，同时由张紧弹簧提供定位柱的张紧力，即可由定位柱与卡槽配合，将瓶盖进行限位固定，从而固定样品瓶，结构更加稳定，有效地避免样品瓶的晃动。