本实用新型公开了一种水质在线监测仪器探头自动清洁装置，包括保护壳、探头本体、清洗装置、连接装置和检测仪连接架，本实用新型设置有保护壳，能够保护探头本体，降低探头本体的损害机率，同时为清洗探头提供方便，控制模块控制阀门三的开启和对气缸发出启动命令，此时，气缸内部的气体通过连接管喷在探头本体上，可将探头本体上的粘附物吹掉，可将一些顽固污染物吹掉，对于探头本体表面的粘附物不多时，可通过控制模块控制阀门二的开启，通过储液箱内部的水进行清洗探头本体。设置的连接装置，便于探头本体从监测仪器取下来，为进一步的维修和更换提供方便。