本实用新型提供了一种天然产物分离纯化装置，涉及天然产物提纯技术领域，包括内部具有冷却腔的冷凝箱、设置于冷却腔内的结晶箱、设置于结晶箱内的刮料装置、通过管道与结晶箱相连通的分离釜和蒸发釜、设置于分离釜内的过滤网板、设置于过滤网板上方的搅拌装置；刮料装置包括第一转轴、第一电机、刮料板，刮料板远离第一转轴的一侧呈波浪状，结晶箱内腔与刮料板相匹配，在做圆周运动过程中刮料板侧壁始终抵合于结晶箱内壁上；搅拌装置包括多个搅拌杆、用于驱动搅拌杆的第二电机；分离釜设有除杂液入口；本实用新型不仅通过边结晶边刮料的方式提高装置的冷凝结晶效率，而且还通过除杂液配合过滤网板溶解杂质，实现天然产物与杂质的有效分离。