本实用新型提供一种丁酸梭菌复合物的混合装置，包括基料预处理单元和混合单元，所述混合单元包括混合主体和菌液投送机构，所述菌液投送机构设置于所述混合主体顶部；所述混合主体包括搅拌机构和混合腔，所述搅拌机构设置于所述混合腔内并垂直于所述混合腔底部，所述搅拌机构包括集液槽、空心搅拌杆以及搅拌桨，所述集液槽设置于所述空心搅拌杆上部，所述搅拌桨设置于所述空心搅拌杆下部。本实用新型的有益效果是：通过搅拌机构的集液槽、空心搅拌杆、搅拌桨以及空心搅拌杆上的进出液口与菌液投送机构喷射器的相互配合，实现菌液在混合腔内横向与纵向的整体输送，保证了菌液与基料的充分均匀混合。