本实用新型公开了一种多肽洗脱装置，属于多肽领域，一种多肽洗脱装置，包括底板，所述底板顶部的左侧固定连接有第一箱体，所述第一箱体的顶部固定连接有第一电机，所述第一电机的输出端固定连接有螺旋杆，所述螺旋杆的底部贯穿至第一箱体的内腔并与第一箱体内腔的底部活动连接，所述第一箱体底部的两侧均连通有导流管，所述导流管的底部与底板连通，所述第一箱体右侧的底部连通有电磁阀，所述电磁阀的右侧连通有第二箱体，通过设置底板、第一箱体、第一电机、螺旋杆、导流管、电磁阀、第二箱体、进料管、第二电机、刷洗杆、出料管、第三箱体、储料盒的箱门的配合使用，解决了现有的多肽洗脱装置清洗效果差。