本实用新型公开了一种洁净分离式的热熔胶投料系统，包括具有上中下三层的楼房、反应釜、下料装置、垃圾收集装置、抽尘装置和洗涤装置，反应釜布置在反应车间，下料装置和垃圾收集装置布置在投料车间，抽尘装置和洗涤装置布置在除尘车间，抽尘装置与洗涤装置连接，下料装置包括投料口和围绕在投料口周围的挡尘机构。此热熔胶投料系统充分利用三维空间优化整条生产线的布局，不同车间实现不同功能，车间布局能够针对不同的功能优化布局，能够提高投料效率、方便管理车间以及净化美化车间，最终降低生产成本。此实用新型用于热熔胶生产领域。