本实用新型公开了一种多频脉冲信号的控制电路，包括芯片、可编程波轮旋钮元件和电源；将可编程波轮旋钮元件与芯片进行连接，通过在芯片内预置嵌入式编译程序，进而使得芯片通过检测对应引脚的电平信号，进而识别得出可编程波轮旋钮的动作信号，进而生成对应的控制指令，并将控制指令通过芯片的输出引脚输出到对应电路模块，控制对应电路模块的工作状态。通过本实用新型只需要通过一个可编程波轮旋钮既可以实现对基于多脉冲信号控制的设备进行开关、模式切换以及脉冲信号强度大小调节等的控制，大大减少了设备上传统按键的数量，使得设备操作更方便。本实用新型还提供了一种基于多频脉冲信号控制的治疗仪。