本实用新型公开了一种海底接驳盒的主控模块冗余切换结构，涉及海底观测技术领域，在本申请的主控模块冗余切换结构中，内部集成有PWM发生器的第一主控模块通过输出脉冲信号的第二端口连接F/V转换器，再连接并控制第一继电器线圈，从而驱动第一继电器开关切换到第二主控模块，在第一主控模块正常工作时，第一主控模块通过第二端口输出的脉冲信号经过F/V转换器处理后输出高电平，在第一主控模块发生故障时，第一主控模块通过第二端口无论输出高电平、低电平还是高阻态，经过F/V转换器处理后都输出低电平，第一主控模块的第二端口在正常工作和发生故障时输出的信号的形式的区分度较大，避免了切换失效的情况，提高了系统的可靠性。