本实用新型涉及水处理技术领域，尤其涉及一种水生态治理系统，包括微纳米气泡发生装置、管道和释放装置，管道上设有至少一个释放装置，释放装置包括流通管和微生物装填器，流通管的一端与管道连接，流通管的另一端与微生物装填器连接，管道与微纳米气泡发生装置连接。本实用新型微纳米气泡进入微生物装填器后包裹住微生物，再由微生物装填器排出至水中，微纳米气泡比表面积大，能够在水中停留较长时间，有利于氧气与微生物结合被微生物所利用吸收，提高微生物的生长繁殖速度，同时提高微生物在水中的传播扩散速率及范围，微生物能够充分发挥有效作用，使待处理水曝气充分，对水质净化、微生物及水生态治理修复均有极大好处。