本实用新型公开了一种植物提取物精馏分离系统，该系统包括精馏室，精馏室内设有若干精馏板沿垂直方向分布，奇数行和偶数行的精馏板分别交错地设于精馏室相对的两面侧壁上，精馏板上设有供溶液缓慢通过的微孔，精馏室的顶部设有一个喷液漏斗，喷液漏斗的侧面设有第一通道和第一风机，第一通道设有一个分支为第二通道，经第一阀门、第二风机与喷液漏斗连接；精馏室底部设有混合液槽。本实用新型通过负压精馏，降低了有机成分分离对温度的需求，同时采用出口冷凝的方式减少负压循环导致的组分损失。该装置通过循环负压分馏将组分分离后，再切换使轻组分分离排出，可满足植物提取物的大规模生产。