一种动物颅骨钻孔装置，包括基台，基台的右侧设有头部固定卡口，基台的右侧部螺纹连接有两个把手螺栓，两个把手螺栓前后对称设置，且每个把手螺栓的内端伸入到头部固定卡口内并连接有顶压板；基台上安装有颅骨钻机构；本实用新型通过颅骨钻进行钻孔，并且颅骨钻的位置可以调整，以适应钻孔位置，颅骨钻在钻孔时依靠驱动组件进行驱动向下移动，整体结构设计合理，使用方便，不会因为认为操作颅骨钻因压力过大误伤大鼠脑部，并且采用顶压板进行固定大鼠头部，防止钻孔时大鼠脑部移动，以误伤到操作人员或大鼠其它部位。