本实用新型涉及一种用于进样瓶的清洗装置及用于进样瓶的流水线式清洗仪。用于进样瓶的清洗装置包括支撑机构、搅拌机构、清洗槽、升降机构、超声波设备及传送机构，搅拌机构包括转盘及多个位于转盘一侧的搅拌叶片，相邻两个搅拌叶片与转盘之间形成一进样瓶的搅拌区，当升降机构带动清洗槽上升时，搅拌机构的搅拌区浸入至清洗剂中，结合转盘与搅拌叶片的搅拌作用及超声波设备的超声作用清洗进样瓶，并将清洗完成的进样瓶通过转盘边缘传送给传送机构。本实用新型提供的用于进样瓶的清洗装置及用于进样瓶的流水线式清洗仪，通过转盘与搅拌叶片的作用，结合利用超声波设备，共同完成对进样瓶的超声搅拌清洗，清洗效率高。