本实用新型涉及种子筛选机技术领域，且公开了一种防堵塞的苗木种子筛选装置。该防堵塞的苗木种子筛选装置，包括上总支架，所述上总支架下端固定焊接支撑脚，所述上总支架的右侧固定焊接横支撑架，所述上总支架固定焊接清楚桶，所述清除桶的右侧设有种子滑口，所述清除桶的中部活动套接有桶传动轴，所述桶传动轴的顶端设有搅拌杆，所述上总支架通过固定杆固定连接过滤撑架，所述过滤撑架的底端活动套接传动轴一，所述传动轴一的外侧活动套接传动轮。该防堵塞的苗木种子筛选装置，通过两组筛网对种子进行筛选以及鼓风机对空瘪种子的去除，对种子的进行全面筛选，将不合格的种子筛选掉，增加了优质种子的数量，提高种子的存活率。