本实用新型公开了一种模块箱房的屋顶防水结构及模块箱房，该屋顶防水结构包括拼接组件和密封盖板，拼接组件为两个，每个拼接组件均包括顶梁、防水板和防水盖板。顶梁为两个，两个顶梁的侧壁相对设置且两个顶梁之间具有第一缝隙，防水板为两个，防水板分别焊接在两个顶梁上，两个防水板靠近彼此的侧边上设有折弯部，两个折弯部之间通过第一连接件相连且两个折弯部之间具有第二缝隙，第二缝隙内设有止水胶条，两个拼接组件的防水板对应拼接，且拼接接缝处扣合有防水盖板，四个防水盖板拼接成十字型，密封盖板扣合在四个防水盖板的拼接处，以遮挡四个防水盖板的拼接缝隙。该屋顶防水结构的密封性较好，较好地避免了模块箱房屋顶漏水的现象。