本实用新型涉及一种保健药品搅拌器清洗机构，包括移动车架，水箱，高压水泵，高压蒸汽发生器，清洗棒以及控制器；移动车架下端面固定有转动轮；水箱固定在移动车架上，水箱为U形结构，其下部连通；高压水泵固定在水箱的U形其中一端的上部；高压蒸汽发生器固定在水箱的U形另一端的中部，且延伸至内部；清洗棒为一端密封的中空软管，其开口端通过耐高压导管分别与高压水泵以及高压蒸汽发生器输出端连接，清洗棒的棒体上开设有小孔，小孔周边固定有刷毛；控制器与高压水泵以及高压蒸汽发生器电连接；本实施例具有以下优点：结构简单，操作方便，能够对内部结构复杂的搅拌器进行有效的清洗，清洗效果好，清洗效率能达到99.9％。