本实用新型公开一种中药材灭菌装置，属于灭菌干燥装置技术领域，包括粉碎室，粉碎室的内部设有绞切转轴，绞切转轴的端部连接有粉碎电机，粉碎室内部的上方设有出风口，出风口的外部通过烘干风道连接有烘干风机，粉碎室的下方设有隔板，隔板的下方设有灭菌室，灭菌室的内部设有一药材容纳槽，药材容纳槽的内部设有搅拌轴，药材容纳槽外部的左右两端联接有翻转轴，翻转轴的端部联接有翻转电机，灭菌室内部的上方设有微波发射装置，灭菌室内部的侧壁上设有加热器和循环风机，灭菌室的下方设有与其相通的倾斜下料通道，倾斜下料通道的末端联接有收料装置；本装置能够在中药材粉碎后进行灭菌处理，灭菌效果好，解决了现有技术中出现的问题。