本实用新型提供全自动医用消毒灭菌装置，在粉碎电机的顶端两侧分别开设有垃圾进料口，粉碎电机固定在粉碎罐体的顶端，粉碎电机的输出轴与粉碎轴相连，在粉碎轴上安装粉碎叶片，过滤装置固装在粉碎罐体底端的垃圾出料口处，蒸汽消毒装置设置在粉碎罐体内，酒精储罐设置在粉碎罐体外，蒸汽发生器与酒精储罐的出液口相连，蒸汽发生器的蒸汽出口与蒸汽管路的入口相连，蒸汽管路的出口与蒸汽管路的入口相连通，蒸汽管路设置在粉碎罐体内，蒸汽口均匀开设在蒸汽管路上。首先利用酒精蒸汽对医疗废物进行初步的酒精消毒作业，然后关闭蒸汽发生器，利用紫外灯对粉碎罐体内的医疗垃圾再进行紫外杀菌作业。