本实用新型公开了一种基于指纹识别的物流支付终端，属于支付设备技术领域，包括支付终端外壳，所述支付终端外壳的内部固定有支付终端本体，所述支付终端本体的背部安装有指纹识别区，该种基于指纹识别的物流支付终端设置有转轴、护板和毛刺层，当使用者对指纹识别区使用完毕后，使用者可以将护板通过转轴进行旋转，由于护板的面积大于指纹识别区的面积，使得护板可以将指纹识别区覆盖，从而防止了指纹识别区沾染灰尘的现象，且护板底部的毛刺层会与指纹识别区接触，当使用者再次将护板通过转轴旋转远离指纹识别区时，毛刺层会将印在指纹识别区上的指纹印刷除，从而使得即便支付终端被盗，也不会泄漏使用者的秘密，提高了支付终端的安全性。