本实用新型公开了一种自动消毒式离心机，包括固定底座，固定底座的顶端表面安装有外筒，外筒远离电动伸缩杆的一侧表面安装有清洁水箱，清洁水箱的顶端表面安装有支架，支架的内部嵌有水泵，水泵的出水端连接有导水管，导水管的末端延伸至外筒的内部且安装有喷淋头，外筒的内部设置有内筒，外筒的内壁周沿环绕设置有凹形固定座，固定座的内部通过转轴安装有滚轮。本实用新型通过对内筒外周沿的顶端部分进行限位，保证内筒在高速转动过程中不会与外筒的内壁发生碰撞，同时在离心机使用完成过后便于对离心机内部进行全方面清洗消毒，无需人工借助外部工具，即方便又快捷。