本实用新型公开了一种利用甲壳素生产废液制备肥料的系统，该系统包括废液池、过滤组件、纳滤组件、静置组件、液肥搅拌罐以及颗粒肥搅拌罐；所述废液池用于放置甲壳素生产废液，所述废液池通过第一提升泵与所述过滤组件相连，所述过滤组件通过第二提升泵与所述纳滤组件相连；所述静置组件通过第三提升泵与所述纳滤组件相连。本申请提供的利用甲壳素生产废液制备肥料的系统，对废液回收利用率高。经纳滤系统，处理后的液体，部分形成小分子活性提高，易被农作物吸收。沉淀物按比例加入草炭中经炭吸附形成液态浆糊状，经过混配设备成为粉状肥料或颗粒肥料。可以实现甲壳素生产废液的无污染的回收再利用。