本实用新型公开了一种具有控温结构的生物医药标本采集装置，包括采集箱体，采集箱体的内壁固定安装有承接台，承接台的上侧壁开设有采集存放槽，采集箱体的内壁对称固定安装有承载块，承载块和承接台的上侧壁开设有通孔，承载块的下侧壁固定安装有抽风风扇，承接台的下侧壁固定安装有槽体，本实用新型通过设置空气循环结构以及加温、制冷装置的配合，在保证空气流通的前提下，根据药物样本习性情况为其提供适宜的保存空间，并通过配置除尘结构，对采集箱体内的尘埃进行收集，避免对医药样本造成影响，通过设置转动杆结构，对采集存放槽进行遮挡，并在采集存放槽内提供橡胶膜挤压结构。