本实用新型公开了一种法兰自动定位上料系统，所述系统包括至少一组法兰自动定位上料装置，包括动力传递装置、法兰对中装置、法兰上料装置和双联离合器，动力传递装置包括电机以及动力输出轴，法兰对中装置包括第一双联齿轮、N组第二双联齿轮、N个对中齿条、N个对中板，在双联离合器的作用下动力输出轴能够驱动第一双联齿轮从而驱动N组第二双联齿轮旋转，对中齿条与对应的第二双联齿轮啮合，对中板与对中齿条的一端固定连接，法兰上料装置包括上料齿轮和与上料齿轮啮合的上料齿条，在双联离合器的作用下动力输出轴能够驱动上料齿轮旋转从而驱动上料齿条上下运动。本实用新型将法兰定位系统与上料系统并联在一起，结构大大简化。