一种核酸扩增检测设备及系统，涉及核酸检测设备领域。核酸扩增检测设备适用于与微流控芯片配合使用，其包括固定架、光学模块、底座和驱动机构，固定架布置有安装区，安装区具有贯穿固定架且与微流控芯片的反应池对应的检测孔；光学模块用于产生预设指向的检测光束以对样本进行检测，并获得荧光信号；驱动机构固定于底座且与固定架连接，用于驱动固定架沿第一预设方向和第二预设方向移动。检测过程中微流控芯片与固定架保持相对静止，设置于微流控芯片的样本也保持相对静止，此时即使反应池互相连通，也可以降低现有的“可能存在反应池之间交叉污染的弊端”的问题的产生。同时，能够对微流控芯片的每个反应池进行逐步扫描，保证数据的准确性。